Epidemiologisk typning av Streptokocker med NGS

Epidemiologiska undersökningar med betydelse för klinik, vårdhygien eller smittskydd.

Analysen utförs på framodlade bakterieisolat (streptokocker) från alla vanligt förekommande patientprover.
Vid analys av patientprover görs först en odling utifrån rutin för det aktuella materialet, vg se instruktion för respektive analys.

Beställare inom Region Skåne:
Ordinera odlingen i eLAB. Ange önskemål om ”Epidemiologisk typning av Streptokocker med NGS” i anamnesrutan alt ring och efterbeställ analysen.
Beställare utanför Region Skåne:
Använd remiss Mikrobiologi. Ange önskemål om ” Epidemiologisk typning av Streptokocker med NGS” i anamnesrutan.

Ange i beställningen om sekvensjämförelse med andra isolat önskas. Om möjligt, ange vilka isolat som ska ingå i analys.
Om möjligt, ange epidemiologisk information som kan underlätta tolkningen av analysen.

Transportera prov snarast till laboratoriet.

Invasiva infektioner med Grupp A Streptokocker är anmälningspliktiga.
Typningsresultat finns tillgängligt via WWBakt samt via papperssvar. Sekvensjämförelse besvaras i pappersform eller genom säker epost (ange om det önskas).